Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COX10Q12887 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COX10Q12887 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COX10Q12887 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COX10Q12887 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COX10Q12887 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COX10Q12887 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COX10Q12887 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COX10Q12887 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COX10Q12887 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COX10Q12887 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COX10Q12887 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COX10Q12887 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COX10Q12887 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COX10Q12887 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COX10Q12887 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COX10Q12887 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COX10Q12887 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX10Q12887 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX10Q12887 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX10Q12887 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX10Q12887 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX10Q12887 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX10Q12887 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX10Q12887 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX10Q12887 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX10Q12887 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX10Q12887 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX10Q12887 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX10Q12887 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX10Q12887 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX10Q12887 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
COX10Q12887 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
COX10Q12887 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX10Q12887 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX10Q12887 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX10Q12887 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COX10Q12887 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COX10Q12887 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COX10Q12887 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COX10Q12887 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX10Q12887 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COX10Q12887 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX10Q12887 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX10Q12887 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COX10Q12887 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX10Q12887 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX10Q12887 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COX10Q12887 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX10Q12887 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX10Q12887 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COX10Q12887 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX10Q12887 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COX10Q12887 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX10Q12887 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COX10Q12887 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
COX10Q12887 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX10Q12887 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COX10Q12887 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
COX10Q12887 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COX10Q12887 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COX10Q12887 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms