Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDC20Q12834 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDC20Q12834 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CDC20Q12834 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CDC20Q12834 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CDC20Q12834 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDC20Q12834 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms