Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGNL1Q0VF96 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms