Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMAGPQ0VAQ4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMAGPQ0VAQ4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMAGPQ0VAQ4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMAGPQ0VAQ4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMAGPQ0VAQ4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMAGPQ0VAQ4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SMAGPQ0VAQ4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMAGPQ0VAQ4 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMAGPQ0VAQ4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMAGPQ0VAQ4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SMAGPQ0VAQ4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMAGPQ0VAQ4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMAGPQ0VAQ4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMAGPQ0VAQ4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMAGPQ0VAQ4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SMAGPQ0VAQ4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMAGPQ0VAQ4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMAGPQ0VAQ4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMAGPQ0VAQ4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMAGPQ0VAQ4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMAGPQ0VAQ4 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMAGPQ0VAQ4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMAGPQ0VAQ4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMAGPQ0VAQ4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMAGPQ0VAQ4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMAGPQ0VAQ4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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