Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFFO1Q0D2I5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms