Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms