Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMODQ06828 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMODQ06828 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMODQ06828 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMODQ06828 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMODQ06828 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMODQ06828 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FMODQ06828 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMODQ06828 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMODQ06828 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FMODQ06828 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FMODQ06828 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMODQ06828 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FMODQ06828 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FMODQ06828 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMODQ06828 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMODQ06828 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMODQ06828 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMODQ06828 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMODQ06828 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMODQ06828 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FMODQ06828 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FMODQ06828 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMODQ06828 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMODQ06828 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FMODQ06828 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMODQ06828 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMODQ06828 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMODQ06828 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMODQ06828 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMODQ06828 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMODQ06828 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMODQ06828 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMODQ06828 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMODQ06828 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMODQ06828 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMODQ06828 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMODQ06828 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FMODQ06828 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMODQ06828 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMODQ06828 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMODQ06828 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMODQ06828 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMODQ06828 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMODQ06828 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FMODQ06828 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FMODQ06828 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FMODQ06828 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms