Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNP2Q05952 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms