Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms