Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms