Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD83Q01151 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD83Q01151 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD83Q01151 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD83Q01151 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD83Q01151 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD83Q01151 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD83Q01151 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD83Q01151 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD83Q01151 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD83Q01151 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD83Q01151 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD83Q01151 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD83Q01151 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD83Q01151 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD83Q01151 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD83Q01151 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD83Q01151 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD83Q01151 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD83Q01151 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD83Q01151 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD83Q01151 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD83Q01151 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD83Q01151 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD83Q01151 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD83Q01151 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD83Q01151 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD83Q01151 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD83Q01151 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD83Q01151 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD83Q01151 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD83Q01151 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD83Q01151 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD83Q01151 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD83Q01151 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD83Q01151 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CD83Q01151 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD83Q01151 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD83Q01151 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD83Q01151 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CD83Q01151 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms