Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms