Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms