Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms