Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO4P98177 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO4P98177 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO4P98177 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO4P98177 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO4P98177 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO4P98177 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO4P98177 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO4P98177 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO4P98177 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO4P98177 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO4P98177 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO4P98177 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO4P98177 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO4P98177 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO4P98177 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO4P98177 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO4P98177 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO4P98177 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO4P98177 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO4P98177 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO4P98177 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms