Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRX1P78414 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRX1P78414 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRX1P78414 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRX1P78414 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms