Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms