Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFM1P61960 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UFM1P61960 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UFM1P61960 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UFM1P61960 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
UFM1P61960 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFM1P61960 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UFM1P61960 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UFM1P61960 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UFM1P61960 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UFM1P61960 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UFM1P61960 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UFM1P61960 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UFM1P61960 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UFM1P61960 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UFM1P61960 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UFM1P61960 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UFM1P61960 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UFM1P61960 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UFM1P61960 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UFM1P61960 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UFM1P61960 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UFM1P61960 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms