Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK11-1P61568 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms