Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PCBP4P57723 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PCBP4P57723 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PCBP4P57723 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCBP4P57723 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms