Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms