Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO3P55854 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms