Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRCA2P51587 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms