Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RAB5CP51148 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RAB5CP51148 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RAB5CP51148 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RAB5CP51148 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RAB5CP51148 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RAB5CP51148 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RAB5CP51148 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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RAB5CP51148 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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RAB5CP51148 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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RAB5CP51148 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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