Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLK1P49759 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLK1P49759 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLK1P49759 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms