Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F4P49335 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms