Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC6A9P48067 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms