Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP5P45974 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP5P45974 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP5P45974 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP5P45974 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP5P45974 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP5P45974 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP5P45974 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP5P45974 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP5P45974 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP5P45974 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP5P45974 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP5P45974 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP5P45974 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP5P45974 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP5P45974 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP5P45974 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
USP5P45974 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP5P45974 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP5P45974 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP5P45974 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP5P45974 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP5P45974 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP5P45974 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP5P45974 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP5P45974 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP5P45974 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP5P45974 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP5P45974 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP5P45974 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP5P45974 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP5P45974 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP5P45974 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP5P45974 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP5P45974 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP5P45974 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP5P45974 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP5P45974 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP5P45974 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP5P45974 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP5P45974 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP5P45974 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP5P45974 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP5P45974 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP5P45974 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP5P45974 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP5P45974 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms