Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP2P42575 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP2P42575 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP2P42575 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP2P42575 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP2P42575 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP2P42575 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP2P42575 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP2P42575 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP2P42575 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP2P42575 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP2P42575 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP2P42575 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP2P42575 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP2P42575 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP2P42575 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CASP2P42575 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP2P42575 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP2P42575 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP2P42575 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP2P42575 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP2P42575 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP2P42575 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP2P42575 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP2P42575 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP2P42575 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP2P42575 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP2P42575 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP2P42575 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP2P42575 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP2P42575 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP2P42575 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP2P42575 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP2P42575 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP2P42575 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms