Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms