Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX11P35716 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX11P35716 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX11P35716 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX11P35716 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX11P35716 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX11P35716 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOX11P35716 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX11P35716 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX11P35716 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX11P35716 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX11P35716 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX11P35716 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX11P35716 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX11P35716 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX11P35716 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX11P35716 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX11P35716 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX11P35716 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX11P35716 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX11P35716 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX11P35716 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX11P35716 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX11P35716 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX11P35716 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX11P35716 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX11P35716 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX11P35716 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX11P35716 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX11P35716 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms