Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA4P35212 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA4P35212 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA4P35212 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA4P35212 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA4P35212 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA4P35212 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA4P35212 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA4P35212 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA4P35212 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA4P35212 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA4P35212 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA4P35212 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA4P35212 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA4P35212 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA4P35212 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA4P35212 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA4P35212 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA4P35212 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA4P35212 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA4P35212 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA4P35212 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA4P35212 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA4P35212 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA4P35212 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA4P35212 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA4P35212 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA4P35212 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA4P35212 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA4P35212 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA4P35212 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA4P35212 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA4P35212 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA4P35212 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA4P35212 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA4P35212 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA4P35212 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA4P35212 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA4P35212 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA4P35212 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA4P35212 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA4P35212 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA4P35212 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA4P35212 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA4P35212 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA4P35212 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA4P35212 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA4P35212 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA4P35212 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA4P35212 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA4P35212 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA4P35212 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA4P35212 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA4P35212 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA4P35212 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA4P35212 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA4P35212 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA4P35212 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA4P35212 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA4P35212 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA4P35212 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA4P35212 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA4P35212 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA4P35212 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.3 ms