Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms