Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms