Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA3P29320 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms