Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
HTR2AP28223 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HTR2AP28223 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HTR2AP28223 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HTR2AP28223 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR2AP28223 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR2AP28223 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR2AP28223 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR2AP28223 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR2AP28223 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR2AP28223 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR2AP28223 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR2AP28223 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTR2AP28223 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms