Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPREP23469 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPREP23469 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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