Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HRCP23327 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HRCP23327 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HRCP23327 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HRCP23327 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HRCP23327 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HRCP23327 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HRCP23327 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HRCP23327 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HRCP23327 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HRCP23327 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HRCP23327 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HRCP23327 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HRCP23327 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HRCP23327 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HRCP23327 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HRCP23327 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HRCP23327 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HRCP23327 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HRCP23327 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HRCP23327 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HRCP23327 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HRCP23327 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HRCP23327 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HRCP23327 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HRCP23327 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HRCP23327 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HRCP23327 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HRCP23327 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HRCP23327 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HRCP23327 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HRCP23327 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HRCP23327 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HRCP23327 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HRCP23327 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HRCP23327 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HRCP23327 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HRCP23327 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HRCP23327 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HRCP23327 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HRCP23327 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HRCP23327 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HRCP23327 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
HRCP23327 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HRCP23327 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HRCP23327 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HRCP23327 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HRCP23327 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HRCP23327 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HRCP23327 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HRCP23327 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HRCP23327 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HRCP23327 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HRCP23327 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HRCP23327 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HRCP23327 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HRCP23327 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HRCP23327 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HRCP23327 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HRCP23327 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HRCP23327 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HRCP23327 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HRCP23327 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HRCP23327 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HRCP23327 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HRCP23327 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HRCP23327 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HRCP23327 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HRCP23327 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HRCP23327 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HRCP23327 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HRCP23327 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HRCP23327 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HRCP23327 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms