Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B1P20020 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B1P20020 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B1P20020 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B1P20020 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B1P20020 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B1P20020 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B1P20020 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B1P20020 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B1P20020 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B1P20020 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B1P20020 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B1P20020 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B1P20020 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B1P20020 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B1P20020 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B1P20020 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B1P20020 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B1P20020 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B1P20020 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B1P20020 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B1P20020 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B1P20020 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B1P20020 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B1P20020 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B1P20020 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B1P20020 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B1P20020 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B1P20020 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B1P20020 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B1P20020 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B1P20020 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B1P20020 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B1P20020 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B1P20020 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B1P20020 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B1P20020 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B1P20020 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B1P20020 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B1P20020 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B1P20020 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms