Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms