Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXB9P17482 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXB9P17482 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB9P17482 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms