Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA1P17302 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA1P17302 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA1P17302 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA1P17302 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA1P17302 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA1P17302 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA1P17302 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA1P17302 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA1P17302 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA1P17302 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA1P17302 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA1P17302 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA1P17302 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA1P17302 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA1P17302 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA1P17302 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA1P17302 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA1P17302 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA1P17302 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA1P17302 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA1P17302 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA1P17302 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA1P17302 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA1P17302 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA1P17302 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA1P17302 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA1P17302 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA1P17302 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA1P17302 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA1P17302 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA1P17302 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA1P17302 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA1P17302 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA1P17302 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA1P17302 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA1P17302 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA1P17302 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA1P17302 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA1P17302 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA1P17302 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA1P17302 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA1P17302 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA1P17302 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA1P17302 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA1P17302 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA1P17302 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA1P17302 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA1P17302 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GJA1P17302 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA1P17302 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA1P17302 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA1P17302 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA1P17302 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA1P17302 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA1P17302 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA1P17302 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA1P17302 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA1P17302 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA1P17302 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA1P17302 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA1P17302 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA1P17302 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA1P17302 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA1P17302 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA1P17302 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA1P17302 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA1P17302 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA1P17302 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA1P17302 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA1P17302 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA1P17302 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA1P17302 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA1P17302 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms