Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GP1BBP13224 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms