Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2C1P13056 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NR2C1P13056 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NR2C1P13056 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NR2C1P13056 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NR2C1P13056 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NR2C1P13056 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NR2C1P13056 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NR2C1P13056 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR2C1P13056 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms