Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GLI4P10075 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GLI4P10075 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GLI4P10075 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GLI4P10075 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GLI4P10075 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GLI4P10075 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GLI4P10075 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GLI4P10075 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GLI4P10075 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GLI4P10075 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI4P10075 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI4P10075 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI4P10075 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI4P10075 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI4P10075 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI4P10075 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI4P10075 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI4P10075 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI4P10075 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI4P10075 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI4P10075 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI4P10075 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI4P10075 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI4P10075 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI4P10075 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI4P10075 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI4P10075 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI4P10075 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GLI4P10075 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms