Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
U2AF1L5P0DN76 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms