Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM10L2BP0DMW5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM10L2BP0DMW5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms