Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN7O95471 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms