Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA4O75335 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms