Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms